1、备料加菌
准备好需要发酵的粪，最好是新鲜牛粪，因为新鲜粪便发酵效果优于老粪便，如鲜牛粪约2.5-3.5吨加1公斤牛粪发酵剂。要先将牛粪发酵剂以1:5-10的比例与米糠(或玉米粉、麦麸)混匀备用。
2、牛粪建堆将备好的牛粪边撒菌边建堆，堆高与体积不能太矮太小。
3、调节水分
发酵牛粪的水分含量应控制在60%-65%。水分怎样判断？手紧抓一把牛粪，指缝见水印但不滴水，落地即散为宜。水少发酵慢，水多通气差，还会导致腐败菌工作而产生臭味，因此一定要把握好水分含量。
4、启动温度
启动温度应在15℃以上较好，四季可作业，不受季节影响，冬天尽量在室内或大棚内发酵，发酵升温控制在70℃-75℃以下为宜。
5、拌匀通气
牛粪发酵剂是需要好(耗)氧发酵，因此，在操作过程中应加大供氧措施，做到拌匀、勤翻、通气为宜。否则会导致厌氧发酵而产生臭味，影响肥料效果。
6、发酵完成
一般在牛粪堆积48小时后，温度升至50℃-60℃，第三天可达65℃以上，在此高温下要翻倒一次，一般情况下，发酵过程中会出现两次65℃以上的高温，翻倒两次既可完成发酵，正常一周内可发酵完成。物料呈黑褐色，温度开始降至常温，表明发酵完成。
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